確保了薄膜蒸發器有諸多的優勢之后，還要讓其正常開車才可以，否則一樣沒有意義。
先是將薄膜蒸發器的循環冷卻水泵打開，使水力噴射冷凝器處于運行狀態；接著依次打開濃縮液容器、抽真空閥、進料閥等裝置，使得料液可以依靠真空度從高位槽抽進設備中。完成之后就可以接通電源，啟動旋轉薄膜蒸發器的電機了。
同時緩慢打開蒸汽閥，讓蒸汽進入夾套，從旁通閥排除夾套內不凝性氣體后，再接通疏水器。這時需要從底部視鏡觀察出料情況，嚴禁在設備內部充滿液體情況下運轉，當系統穩定一段時間之后，才可以取樣分析濃縮液濃度，調節進料閥開啟量大小使濃縮液達到預定需要的濃度。