紫杉醇是一種天然抗癌藥物,長期以來,紫杉醇來源于有“植物大熊貓”之稱的紅豆杉,難以人工合成。紫杉醇究竟有何基因密碼?阻礙人工合成的原因在哪里?近日,記者從中國農科院獲悉,我國科學家通過對南方紅豆杉進行全基因組測序,首次組裝成功了染色體級別的高質量參考基因組,揭示了抗癌藥物紫杉醇生物合成的遺傳基礎,相關研究論文近日在線發表于預印平臺bioRxiv。
來自于珍稀植物的抗癌藥物
紫杉醇是紅豆杉屬植物中的一種復雜的次生代謝產物,是世界上使用最廣泛的明星抗癌藥物。上世紀60年代,美國化學家沃爾和瓦尼從一種紅豆杉屬的植物太平洋紫杉的樹皮中,分離出紫杉醇。經過二十多年的臨床研究,1992年首款紫杉醇注射液“Taxol”上市。至今,紫杉醇是已知療效最好的植物源抗腫瘤藥物之一,具有高效、低毒、廣譜的特點,對卵巢癌、乳腺癌、惡性黑色素瘤、肺癌、前列腺癌、腦癌和大腸癌等具有明顯的治療效果。
醫學實驗結果顯示,目前想要獲取紫杉醇類原料藥,主要依賴紅豆杉植物類提取和化學半合成??蒲泄ぷ髡邆儾杉斯づ嘤募t豆杉枝葉,利用溶劑萃取、固相萃取、超臨界流體萃取、膜分離、色譜分離等分離提取方法,提取與紫杉醇結構類似的前體,如巴卡亭Ⅲ、10-去乙酰巴卡亭Ⅲ等,再借助化學修飾的大規模生產方法,得到醫用紫杉醇原料藥。
中國農業科學院農業基因組研究所研究員閆建斌介紹,現行的紫杉醇提取及半化學合成方法均嚴重依賴紅豆杉資源,而目前世界范圍內還沒有形成大規模的紅豆杉原料林基地。
據科學家推算,腫瘤患者單個療程就需消耗2 克以上的紫杉醇。這些微量的紫杉醇則需要從4-8棵生長超過50年的野生紅豆杉樹皮中提取。一方面是紅豆杉與紫杉醇的稀缺,另一方面是巨大的醫療需求,這就導致紅豆杉原料常年價格高昂,供不應求。
據介紹,目前世界上,尚無成規模的人工種植紅豆杉項目,而野生的紅豆杉極其稀缺,在我國,紅豆杉是國家一級珍惜瀕危保護植物,同時,全世界有42個國家將紅豆杉稱為“國寶”。
揭開紫杉醇合成的秘密
據閆建斌介紹,在此次研究中,科研人員利用第三代測序技術,獲得基因組的測序讀段(reads),高深度的測序飽和覆蓋南方紅豆杉基因組,然后再從頭拼接,從而還原紅豆杉各染色體的序列片段。
之后,科研工作者們結合輔助基因組組裝Hi-C測序方法,捕獲全基因組范圍內整染色體質DNA在空間位置上的關系,確定序列片段在染色體上的方向和順序,最終確定基因組各染色體上ATCG四種堿基的排列順序。
研究通過對南方紅豆杉單倍體胚乳組織進行全基因測序,成功組裝了染色體級別的高質量南方紅豆杉參考基因。
研究顯示,紫杉醇合成相關基因的基因組定位和協同表達調控,繪制了多個相關基因家族的基因組位置圖譜,特別揭示了細胞色素P450家族的基因組分布和調控規律。研究首次發現了紫杉醇合成基因在紅豆杉9號染色體上的聚集分布現象,并在其中鑒定了首個紫杉醇生物合成基因簇,由六個基因串聯組成,主要負責催化紫杉醇生物合成的前兩步。
未來可以人工合成嗎?
獲得一個物種的基因組序列,對于該物種的研究具有重要意義。
從紫杉醇被發現開始,科學家們經過半個多世紀的研究,完成了對其構效關系、藥物劑型、藥物來源、臨床應用、作用機制等方面的研究工作。但是,“迄今為止,紅豆杉如何合成紫杉醇這一關鍵科學問題,還沒有被完全解析”,閆建斌介紹:“本次研究對紅豆杉基因組的測序完成,為解決該關鍵科學問題提供了重要基石,也為下一步開發綠色環保、可持續生產的紫杉醇合成策略提供了思路”。
除此之外,本次研究對南方紅豆杉的相關研究也做出了重要努力。南方紅豆杉是一種較古老的裸子植物。其參考基因組的發布,填充了裸子植物基因庫的空缺,為植物界的演化研究提供了一個重要案例。南方紅豆杉基因組信息還將有助于高效開發該物種的分子標記,這些分子標記將直接用于指導相關林木育種工作,加速紅豆杉屬物種遺傳改良工作,實現全基因選育抗逆性好、生長迅速、紫杉醇含量高的優良紅豆杉品種。
長期以來,國外在紅豆杉和紫杉醇的研究開發進程中一直處于領先狀態。中國科學家們對于紅豆杉基因組的率先解析,是該領域的重大突破,不僅大大提高了我國相關領域的研究水平,還有望促進我國紫杉醇生物合成與調控研究及進一步產業化。
辟謠:紅豆杉泡水有用嗎?
由于紅豆杉是提取紫杉醇的原料,民間有“用紅豆杉做的茶杯喝水、用紅豆杉組織煮水或泡酒可以防癌”的傳言,這樣做真的有效果嗎?
答案是否定的。據相關專家介紹,紅豆杉木材中的紫杉醇含量極低,而且在不同部位含量分布差異較大。用紅豆杉做茶杯喝水,不可能獲得有效紫杉醇濃度,更不可能起到抗癌作用。而且,由于紫杉醇及紅豆杉的其他代謝產物有生物毒性,盲目采用紅豆杉組織煮水和泡酒,不僅無法防癌,反而可能對身體有害。
相關醫學專家稱,紫杉醇的抗癌機制非常復雜,主要通過與β-微管蛋白亞基結合,抑制微管解聚,阻斷細胞分裂和誘導細胞凋亡,從而控制癌細胞的發展。使用紫杉醇時,若劑量不合適,可能造成白細胞減少、過敏反應、心血管毒性等負面效果。
(單位:中國農業科學院農業基因組研究所 )
來自于珍稀植物的抗癌藥物
紫杉醇是紅豆杉屬植物中的一種復雜的次生代謝產物,是世界上使用最廣泛的明星抗癌藥物。上世紀60年代,美國化學家沃爾和瓦尼從一種紅豆杉屬的植物太平洋紫杉的樹皮中,分離出紫杉醇。經過二十多年的臨床研究,1992年首款紫杉醇注射液“Taxol”上市。至今,紫杉醇是已知療效最好的植物源抗腫瘤藥物之一,具有高效、低毒、廣譜的特點,對卵巢癌、乳腺癌、惡性黑色素瘤、肺癌、前列腺癌、腦癌和大腸癌等具有明顯的治療效果。
醫學實驗結果顯示,目前想要獲取紫杉醇類原料藥,主要依賴紅豆杉植物類提取和化學半合成??蒲泄ぷ髡邆儾杉斯づ嘤募t豆杉枝葉,利用溶劑萃取、固相萃取、超臨界流體萃取、膜分離、色譜分離等分離提取方法,提取與紫杉醇結構類似的前體,如巴卡亭Ⅲ、10-去乙酰巴卡亭Ⅲ等,再借助化學修飾的大規模生產方法,得到醫用紫杉醇原料藥。
中國農業科學院農業基因組研究所研究員閆建斌介紹,現行的紫杉醇提取及半化學合成方法均嚴重依賴紅豆杉資源,而目前世界范圍內還沒有形成大規模的紅豆杉原料林基地。
據科學家推算,腫瘤患者單個療程就需消耗2 克以上的紫杉醇。這些微量的紫杉醇則需要從4-8棵生長超過50年的野生紅豆杉樹皮中提取。一方面是紅豆杉與紫杉醇的稀缺,另一方面是巨大的醫療需求,這就導致紅豆杉原料常年價格高昂,供不應求。
據介紹,目前世界上,尚無成規模的人工種植紅豆杉項目,而野生的紅豆杉極其稀缺,在我國,紅豆杉是國家一級珍惜瀕危保護植物,同時,全世界有42個國家將紅豆杉稱為“國寶”。
揭開紫杉醇合成的秘密
據閆建斌介紹,在此次研究中,科研人員利用第三代測序技術,獲得基因組的測序讀段(reads),高深度的測序飽和覆蓋南方紅豆杉基因組,然后再從頭拼接,從而還原紅豆杉各染色體的序列片段。
之后,科研工作者們結合輔助基因組組裝Hi-C測序方法,捕獲全基因組范圍內整染色體質DNA在空間位置上的關系,確定序列片段在染色體上的方向和順序,最終確定基因組各染色體上ATCG四種堿基的排列順序。
研究通過對南方紅豆杉單倍體胚乳組織進行全基因測序,成功組裝了染色體級別的高質量南方紅豆杉參考基因。
研究顯示,紫杉醇合成相關基因的基因組定位和協同表達調控,繪制了多個相關基因家族的基因組位置圖譜,特別揭示了細胞色素P450家族的基因組分布和調控規律。研究首次發現了紫杉醇合成基因在紅豆杉9號染色體上的聚集分布現象,并在其中鑒定了首個紫杉醇生物合成基因簇,由六個基因串聯組成,主要負責催化紫杉醇生物合成的前兩步。
未來可以人工合成嗎?
獲得一個物種的基因組序列,對于該物種的研究具有重要意義。
從紫杉醇被發現開始,科學家們經過半個多世紀的研究,完成了對其構效關系、藥物劑型、藥物來源、臨床應用、作用機制等方面的研究工作。但是,“迄今為止,紅豆杉如何合成紫杉醇這一關鍵科學問題,還沒有被完全解析”,閆建斌介紹:“本次研究對紅豆杉基因組的測序完成,為解決該關鍵科學問題提供了重要基石,也為下一步開發綠色環保、可持續生產的紫杉醇合成策略提供了思路”。
除此之外,本次研究對南方紅豆杉的相關研究也做出了重要努力。南方紅豆杉是一種較古老的裸子植物。其參考基因組的發布,填充了裸子植物基因庫的空缺,為植物界的演化研究提供了一個重要案例。南方紅豆杉基因組信息還將有助于高效開發該物種的分子標記,這些分子標記將直接用于指導相關林木育種工作,加速紅豆杉屬物種遺傳改良工作,實現全基因選育抗逆性好、生長迅速、紫杉醇含量高的優良紅豆杉品種。
長期以來,國外在紅豆杉和紫杉醇的研究開發進程中一直處于領先狀態。中國科學家們對于紅豆杉基因組的率先解析,是該領域的重大突破,不僅大大提高了我國相關領域的研究水平,還有望促進我國紫杉醇生物合成與調控研究及進一步產業化。
辟謠:紅豆杉泡水有用嗎?
由于紅豆杉是提取紫杉醇的原料,民間有“用紅豆杉做的茶杯喝水、用紅豆杉組織煮水或泡酒可以防癌”的傳言,這樣做真的有效果嗎?
答案是否定的。據相關專家介紹,紅豆杉木材中的紫杉醇含量極低,而且在不同部位含量分布差異較大。用紅豆杉做茶杯喝水,不可能獲得有效紫杉醇濃度,更不可能起到抗癌作用。而且,由于紫杉醇及紅豆杉的其他代謝產物有生物毒性,盲目采用紅豆杉組織煮水和泡酒,不僅無法防癌,反而可能對身體有害。
相關醫學專家稱,紫杉醇的抗癌機制非常復雜,主要通過與β-微管蛋白亞基結合,抑制微管解聚,阻斷細胞分裂和誘導細胞凋亡,從而控制癌細胞的發展。使用紫杉醇時,若劑量不合適,可能造成白細胞減少、過敏反應、心血管毒性等負面效果。
(單位:中國農業科學院農業基因組研究所 )
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